PENCARIAN KANDIDAT SENYAWA OBAT BAHAN ALAM DI INDONESIA DENGAN TARGET RESEPTOR HISTAMIN H4 SEBAGAI ANTIHISTAMIN DENGAN METODE STRUCTURE-BASED VIRTUAL SCREENING (SBVS)

Histamin merupakan mediator utama timbulnya peradangan,
dan gejala alergi (Gunawijaya, 2017). Antihistamin merupakan pengobatan
standar untuk penyakit alergi yang dihubungkan sel mast, menargetkan reseptor
H1, dan H4 bisa menjadi pengobatan yang efektif. Melihat salah satu alternatif
pengobatan menggunakan bahan alam, dan kaitannya dengan peran penting
reseptor histamin H4 dalam penemuan obat antihistamin, maka penelitian ini perlu
dilakukan, dalam rangka untuk pencarian kandidat senyawa obat yang berasal
dari tanaman bahan alam.
Tujuan: Melakukan penapisan secara virtual senyawa-senyawa dalam tanaman
obat di Indonesia dengan target reseptor Histamin H4, melakukan simulasi
dinamika molekul pada kompleks hasil penapisan virtual dan menghitung energi
bebas ikatan paling stabil, dan melakukan validasi internal kompleks paling stabil
dengan simulasi penambatan ulang.
Metode: Penelitian ini menlakukan uji in silico dengan metode simulasi
penambatan molekul, simulasi dinamika molekul, dan penambatan ulang.
Kesimpulan: Dari 40 tanaman yang diteliti terpilih satu tanaman yang terbaik
yaitu, tanaman mengkudu dengan pengkodean LTS0195312 dengan energi bebas
ikatan paling rendah -11,5 Kkal/Mol, jarak antara ligan dan reseptor yaitu kurang
dari 3,5Å, memiliki nilai RSMD <2Å, berat molekul kurang dari 500DA, dan
berikatan dengan asam amino. Pada simulasi dinamika molekul snapshoot ke 78
paling stabil karena mempunyai energi bebas ikatan -14.9970 kjol/mol. Pada
tanaman mengkudu ikatan yang terbentuk yaitu 2,4Å, dengan rentang nilai RMSD
0,2-03Å.