STUDI PENAPISAN TANAMANAN OBAT DI INDONESIA DENGAN TARGET RESEPTOR ADRB2 (PDB: 2RH1) SEBAGAI BRONKODILATOR DENGAN METODE STRUCTURE-BASED VIRTUAL SCREENING (SBVS)

Latar belakang: Penyakit Paru Obstruktif Kronik (PPOK) adalah masalah
kesehatan masyarakat utama yang mempengaruhi 328 juta orang. Beta-2 agonis
adalah bronkodilator yang sangat bagus untuk pengobatan asma, Penelitian ini
menggunakan senyawa bahan alam yang ada di Indoneisa, senyawa yang
diidentifikasi mempunyai khasiat untuk penyakit bronkodilator. Dengan reseptor
yang digunakan adalah beta-2 adrenergic. Tujuan: Untuk melakukan penapisan
virtual senyawa tanaman obat dengan reseptor ADRB-2 dengan dilakukan simulasi
dinamika molekul untuk ikatan yang stabil dengan validasi penambatan ulang.
Metode: Yaitu simulasi penambatan molekul untuk skrening senyawa bahan alam,
simulasi penambatan ulang untuk melihat stabilitas ligan didalam kantung ikatan
reseptor dengan perangkat lunak YASARA-Stucture. Kesimpulan: Hasil simulasi
dinamika molekul menunjukan bahwa interaksi brobkodilator dengan sisis aktif
reseptor mencapai stabilitas tanaman seledri dengan kode LTS0158292 pada snap
shoot nomor 195, energi bebas ikatan yang terbentuk sebesar -12,6100 kkal/mol.
Terbentuk ikatan hydrogen biasa antara ligan bronkodilator dengan asam amino
Asp113, jarak ikatan antar atom yang terbentuk sebesar 0,5 Å - 8,0 Å < 2 Å.
Kata kunci: Seledri (Apium graveolens L), Bronkodilator, Beta-2 Adrenergic,
Penambatan molekul, Simulasi Dinamika Molekul, Penambatan Ulang.