PENAPISAN VIRTUAL BERBASIS STRUKTUR (PVBS) SENYAWA TANAMAN OBAT DI INDONESIA DENGAN TARGET RESEPTOR BETA-2 ADRENERGIC (PDB:2RH1) SEBAGAI ANTIINFLAMASI

Asma merupakan penyakit inflamasi kronis pada bagian saluran
napas yang ditandai dengan obstruksi jalan napas, dimana peran reseptor ADRB-2
sangat penting dalam memulihkan fungsi paru-paru dan pembersihan jalan napas
dengan menginduksi efek antiinflamasi. Tanaman obat digunakan sebagai bahan
utama dalam penemuan obat baru, dilakukan secara in silico yang lebih mudah
dan hanya memerlukan waktu yang relatif cepat. Maka penelitian ini akan
dilakukan dengan menggunakan beberapa metode diantaranya penambatan
molekul, simulasi dinamika molekul, dan penambatan ulang (Re-docking).
Metode: Penelitian ini dillakukan dengan uji in silico dengan metode simulasi
penambatan molekul, simulasi dinamika molekul, dan penambatan ulang. Hasil:
Hasil PVBS dari 40 tanaman obat di Indonesia menggunakan Autodock vina
diperoleh tanaman Mentimun (Cucumis sativus L.) dengan binding energy sebesar -11,50 kkal/mol dengan kode lotus yaitu LTS0196828, berikatan dengan Asn293,
dan jarak ikatan sebesar 2,536 Å. Hasil simulasi dinamika molekul menghasilkan
ikatan hidrogen dengan jarak 2,499 Å dan berikatan salah satu asam amino yaitu
Asn312. Penambatan ulang 1000 kali dihasilkan nilai RMSD ≤ 2 Å yang
menunjukkan stabilitas sangat baik dan valid. Senyawa dari tanaman Mentimun
(Cucumis sativus L.) disinyalir memiliki aktivitas sebagai antiinflamasi karena
memiliki ikatan hidrogen dengan salah satu asam amino yaitu Asn312, dan jarak
ikatan yang sebesar 2,499 Å. Kesimpulan: Tanaman Mentimun (Cucumis sativus
L.) disinyalir memiliki aktivitas sebagai antiinflamasi karena memiliki ikatan
hidrogen dengan salah satu asam amino yaitu Asn312, dan jarak ikatan yang
sebesar 2,499 Å.
Kata kunci: Tanaman di Indonesia, Komputasi, PVBS, ADRB-2, Antiinflamasi.